MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 plasmid pMAR2

Total Repeats: 2107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011603	TCA	2	6	125	130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011603	GCT	2	6	193	198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011603	GGACAA	2	12	235	246	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011603	A	6	6	256	261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011603	TCC	2	6	284	289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215276193
6	NC_011603	GAA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276193
7	NC_011603	A	8	8	395	402	100 %	0 %	0 %	0 %	215276193
8	NC_011603	GAA	2	6	428	433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276193
9	NC_011603	TC	3	6	446	451	0 %	50 %	0 %	50 %	215276193
10	NC_011603	TGGATA	2	12	498	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
11	NC_011603	ATTC	2	8	536	543	25 %	50 %	0 %	25 %	215276193
12	NC_011603	CAGT	2	8	622	629	25 %	25 %	25 %	25 %	215276193
13	NC_011603	CTCA	2	8	661	668	25 %	25 %	0 %	50 %	215276193
14	NC_011603	CA	3	6	733	738	50 %	0 %	0 %	50 %	215276193
15	NC_011603	TGC	3	9	834	842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276193
16	NC_011603	AG	3	6	904	909	50 %	0 %	50 %	0 %	215276193
17	NC_011603	AGC	2	6	1014	1019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276193
18	NC_011603	CATT	2	8	1081	1088	25 %	50 %	0 %	25 %	215276193
19	NC_011603	CCG	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	215276193
20	NC_011603	ATG	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
21	NC_011603	GCCA	2	8	1144	1151	25 %	0 %	25 %	50 %	215276193
22	NC_011603	CTC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	215276193
23	NC_011603	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276193
24	NC_011603	TACT	2	8	1285	1292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011603	TA	3	6	1339	1344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011603	TGA	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011603	CTTC	2	8	1377	1384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011603	TCAC	2	8	1504	1511	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011603	CAC	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011603	TA	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011603	G	6	6	1585	1590	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011603	CAT	2	6	1613	1618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011603	GGC	2	6	1650	1655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011603	CGG	2	6	1897	1902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011603	GGT	2	6	1908	1913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011603	TGG	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011603	AAC	2	6	2029	2034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011603	AT	3	6	2056	2061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011603	AGG	2	6	2065	2070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011603	AGG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011603	CCG	2	6	2127	2132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011603	AAT	2	6	2211	2216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011603	GTT	2	6	2217	2222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011603	GCAC	2	8	2245	2252	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011603	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011603	TGT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011603	ATT	2	6	2345	2350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011603	TCC	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011603	G	8	8	2513	2520	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011603	AT	3	6	2527	2532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011603	A	10	10	2533	2542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011603	A	7	7	2544	2550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011603	ATT	2	6	2552	2557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011603	T	8	8	2556	2563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011603	T	6	6	2581	2586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011603	ATT	2	6	2596	2601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011603	GTCT	2	8	2683	2690	0 %	50 %	25 %	25 %	215276194
58	NC_011603	TTGA	2	8	2691	2698	25 %	50 %	25 %	0 %	215276194
59	NC_011603	GCTTGC	2	12	2711	2722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
60	NC_011603	TAC	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276194
61	NC_011603	ACA	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276194
62	NC_011603	A	7	7	2925	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	215276194
63	NC_011603	AACC	2	8	2933	2940	50 %	0 %	0 %	50 %	215276194
64	NC_011603	G	7	7	2946	2952	0 %	0 %	100 %	0 %	215276194
65	NC_011603	CAT	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276194
66	NC_011603	GCT	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
67	NC_011603	CTG	2	6	3160	3165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276194
68	NC_011603	ATA	2	6	3233	3238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011603	TAT	2	6	3255	3260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011603	T	9	9	3290	3298	0 %	100 %	0 %	0 %	215276195
71	NC_011603	T	6	6	3356	3361	0 %	100 %	0 %	0 %	215276195
72	NC_011603	TAA	2	6	3434	3439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276195
73	NC_011603	TAT	2	6	3497	3502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276195
74	NC_011603	GAT	2	6	3562	3567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276195
75	NC_011603	ACT	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276195
76	NC_011603	TTA	2	6	3617	3622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276195
77	NC_011603	GAA	2	6	3816	3821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
78	NC_011603	ACAG	2	8	3859	3866	50 %	0 %	25 %	25 %	215276196
79	NC_011603	TA	3	6	3871	3876	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
80	NC_011603	ATT	2	6	3943	3948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276196
81	NC_011603	TGA	2	6	3975	3980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
82	NC_011603	CT	3	6	3985	3990	0 %	50 %	0 %	50 %	215276196
83	NC_011603	A	6	6	4091	4096	100 %	0 %	0 %	0 %	215276196
84	NC_011603	ATC	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
85	NC_011603	ATC	2	6	4155	4160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
86	NC_011603	GC	3	6	4193	4198	0 %	0 %	50 %	50 %	215276196
87	NC_011603	AGTATA	2	12	4297	4308	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276196
88	NC_011603	GGT	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276196
89	NC_011603	A	6	6	4332	4337	100 %	0 %	0 %	0 %	215276196
90	NC_011603	AGT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
91	NC_011603	TCT	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276196
92	NC_011603	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
93	NC_011603	AT	3	6	4566	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
94	NC_011603	ACA	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
95	NC_011603	CAG	2	6	4644	4649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276196
96	NC_011603	CAA	2	6	4730	4735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
97	NC_011603	GTG	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	215276196
98	NC_011603	CATCTG	2	12	4838	4849	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	215276196
99	NC_011603	GTCAG	2	10	4860	4869	20 %	20 %	40 %	20 %	215276196
100	NC_011603	TCA	2	6	4936	4941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276196
101	NC_011603	ACA	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276196
102	NC_011603	TGA	2	6	4985	4990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
103	NC_011603	TGA	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276196
104	NC_011603	AT	3	6	5021	5026	50 %	50 %	0 %	0 %	215276196
105	NC_011603	TTG	2	6	5057	5062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	215276196
106	NC_011603	AAT	2	6	5068	5073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276196
107	NC_011603	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276196
108	NC_011603	ATT	2	6	5311	5316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276196
109	NC_011603	AAT	2	6	5346	5351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276197
110	NC_011603	TAT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276197
111	NC_011603	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	215276197
112	NC_011603	CTG	2	6	5605	5610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	215276197
113	NC_011603	GAT	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276197
114	NC_011603	A	7	7	5693	5699	100 %	0 %	0 %	0 %	215276197
115	NC_011603	GAA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276197
116	NC_011603	TCA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276197
117	NC_011603	TA	3	6	5893	5898	50 %	50 %	0 %	0 %	215276197
118	NC_011603	GAA	2	6	5946	5951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276197
119	NC_011603	GGGAA	2	10	5992	6001	40 %	0 %	60 %	0 %	215276197
120	NC_011603	ATTC	2	8	6046	6053	25 %	50 %	0 %	25 %	215276197
121	NC_011603	AGC	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	215276197
122	NC_011603	AT	3	6	6154	6159	50 %	50 %	0 %	0 %	215276197
123	NC_011603	T	6	6	6180	6185	0 %	100 %	0 %	0 %	215276197
124	NC_011603	ATGATA	2	12	6217	6228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	215276197
125	NC_011603	ATA	2	6	6312	6317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276197
126	NC_011603	CCGT	2	8	6369	6376	0 %	25 %	25 %	50 %	215276197
127	NC_011603	TTTTTC	2	12	6404	6415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	215276197
128	NC_011603	TTCT	2	8	6448	6455	0 %	75 %	0 %	25 %	215276197
129	NC_011603	T	6	6	6526	6531	0 %	100 %	0 %	0 %	215276197
130	NC_011603	A	7	7	6550	6556	100 %	0 %	0 %	0 %	215276198
131	NC_011603	T	6	6	6567	6572	0 %	100 %	0 %	0 %	215276198
132	NC_011603	TTC	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276198
133	NC_011603	AGA	2	6	6648	6653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	215276198
134	NC_011603	AAAT	2	8	6654	6661	75 %	25 %	0 %	0 %	215276198
135	NC_011603	ATG	2	6	6730	6735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	215276198
136	NC_011603	A	8	8	6777	6784	100 %	0 %	0 %	0 %	215276198
137	NC_011603	A	6	6	6853	6858	100 %	0 %	0 %	0 %	215276198
138	NC_011603	GTGA	2	8	6934	6941	25 %	25 %	50 %	0 %	215276198
139	NC_011603	TAA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	215276198
140	NC_011603	AAACA	2	10	7032	7041	80 %	0 %	0 %	20 %	215276199
141	NC_011603	A	6	6	7043	7048	100 %	0 %	0 %	0 %	215276199
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269	NC_011603	GTAA	2	8	11856	11863	50 %	25 %	25 %	0 %	215276203
270	NC_011603	AAAAG	2	10	11898	11907	80 %	0 %	20 %	0 %	215276204
271	NC_011603	ATT	2	6	11943	11948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276204
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273	NC_011603	ATT	2	6	11994	11999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	215276204
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406	NC_011603	A	7	7	17803	17809	100 %	0 %	0 %	0 %	215276210
407	NC_011603	CTT	2	6	17837	17842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	215276210
408	NC_011603	ACT	2	6	17854	17859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	215276210
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430	NC_011603	A	7	7	18448	18454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_011603	ACT	2	6	18465	18470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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437	NC_011603	A	6	6	18725	18730	100 %	0 %	0 %	0 %	215276212
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442	NC_011603	ATA	2	6	18876	18881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_011603	CAGAA	2	10	18893	18902	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
444	NC_011603	ATA	2	6	19015	19020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_011603	CA	3	6	19093	19098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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448	NC_011603	GCCA	2	8	19178	19185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
449	NC_011603	TTCT	2	8	19198	19205	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
450	NC_011603	TGC	2	6	19218	19223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_011603	TGA	2	6	19248	19253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
452	NC_011603	GCA	2	6	19418	19423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_011603	CG	3	6	19539	19544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
454	NC_011603	GT	3	6	19651	19656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_011603	CAG	2	6	19696	19701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_011603	ACTG	2	8	19710	19717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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459	NC_011603	GTT	2	6	20060	20065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_011603	TTA	2	6	20149	20154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_011603	A	7	7	20349	20355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_011603	A	6	6	20402	20407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_011603	AAACA	2	10	20435	20444	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
469	NC_011603	AAG	2	6	20470	20475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
470	NC_011603	CAG	2	6	20489	20494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_011603	ATC	2	6	20520	20525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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497	NC_011603	TG	3	6	21951	21956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_011603	TAG	2	6	21976	21981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
499	NC_011603	TAA	2	6	22009	22014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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